Рак: Ці 4 гени допомагають передбачити результат
Широке дослідження ролі супресора пухлини p53 пропонує глибше розуміння генетичних мутацій, що відіграють роль у різних формах раку, а також визначення чотирьох генів, які можуть допомогти передбачити світогляд людини.
TP53 ген відповідає за кодування того, що вчені називають пухлинним білком p53 - супресором пухлини, який може зупинити клітини від швидкого розподілу та розмноження.
Дослідники охрестили TP53 «охоронцем геному» через його вирішальну роль у запобіганні пухлинах та контролі клітинного поділу.
Рак людини часто має мутації в TP53 гена, що призводить до збою одного з найважливіших захисних механізмів проти раку.
Перші дослідження, які виявили TP53 мутації раку людини з’явилися у 1980-х роках, і з тих пір дослідники приділяють багато часу та ресурсів для з’ясування його ролі у раку.
Зараз, найбільше у своєму роді дослідження використовує зразки пухлини понад 10 000 хворих на рак і вивчає 32 різні типи раку, щоб краще зрозуміти роль TP53.
Доктор Ларрі Донехауер, професор молекулярної вірусології та мікробіології з Медичного коледжу Бейлора в Х'юстоні, штат Техас, очолив нове дослідження, яке з'являється в журналі Звіти стільникових мереж.
Гени Telltale 4 можуть допомогти передбачити світогляд
Доктор Донехауер та команда використали п'ять різних платформ даних для вилучення 10 225 зразків із 32 видів раку. Використовуючи Атлас геному раку (TCGA), дослідники змогли всебічно оцінити роль шляху p53 у цих 32 видах раку.
Потім доктор Донехауер та його колеги порівняли дані TCGA з іншою базою даних про 80 000 генетичних мутацій, яку доктор Тьєррі Суссі, професор молекулярної біології в Університеті Сорбони в Парижі, Франція, збирав протягом 30 років.
Дослідники виявили, що TP53 мутації частіше траплялись у людей, які мали бідніший світогляд. Крім того, аналіз показав, що «Більше 91% ракових захворювань із TP53 мутації показують втрату обох функціональних TP53 алелі », або генні варіанти.
Доктор Донехауер пояснює: "У деяких генах раку ви побачите одну копію двох генів, втрачених або мутованих", але "понад 91 відсотків усіх видів раку втрачають обидва TP53 гени, а не лише один ".
Друга втрата алеля, як пишуть автори, сталася внаслідок "мутації, хромосомної делеції або нейтральної до копіювання втрати гетерозиготності" - тобто дублювання генів. Провідний дослідник також зазначає, що цей останній процес відбувався набагато частіше, ніж вони вважали раніше.
Що важливо, дослідження також виявило чотири гени, які демонстрували надмірну експресію у мутантів TP53 пухлини. На думку дослідників, ці чотири гени можуть "визначити", чи має хворий на рак хороший прогноз чи ні.
"Якщо у вас висока експресія цих чотирьох генів, у вас є пацієнт, у якого, швидше за все, буде поганий прогноз [...] І навпаки, якщо цей пацієнт має дуже низьку експресію цих генів, він, ймовірно, виживе довше і матиме хороший прогноз ".
Доктор Ларрі Донехауер
"Це дасть вам краще уявлення про те, як він буде жити, ніж просто знати, чи він мутант TP53 чи ні, - продовжує доктор Донехауер.
Нарешті, дослідження сильно пов'язане TP53 мутації з геномною нестабільністю, знахідка, яка відповідає TP53Типова роль "охоронця геному".
Доктор Донехауер коментує унікальність нового дослідження, кажучи: «Більшість досліджень з TP53 зосередитися на одному типі раку ".
"Переглядаючи 32 різні типи раку, ви бачите, що певні закономірності зберігаються незалежно від типу раку".
Співавтор дослідження та директор з генетики раку в Медичному коледжі Бейлора, доктор Девід Вілер, також коментує важливість висновків.
Він каже: «Оскільки TP53 є одним з найважливіших воротарів у профілактиці раку, чим краще ми розуміємо цей ген, тим краще ми зможемо зрозуміти основну біологію раку. Це призведе до кращої терапії ".
