Профілактика герпетичних інфекцій: Дослідження пропонує нові уявлення
Нові дослідження визначають ключовий фактор, який визначає прогресування вірусу герпесу, і показує, що його орієнтація може уповільнити прогресування вірусу.
Згідно з останніми статистичними даними Центрів з контролю та профілактики захворювань (CDC), у 2015–2016 рр. Майже 48% людей у Сполучених Штатах жили з простим герпесом 1, вірусним штамом, який викликає інфекції порожнини рота.
У всьому світі вірус має 80% населення. Після того, як людина заразиться нею, вірус ніколи не зникає - він залишається в неактивному стані в організмі протягом усього життя.
Хоча симптоми герпесу іноді залишаються непоміченими, для деяких людей вони можуть бути неприємними та болючими.
Вірус герпесу також є дуже заразним, оскільки людина може передавати його навіть тоді, коли у нього відсутні симптоми.
Нові дослідження показують, що зараження вірусом незабаром можна запобігти, оскільки вчені пропонують нові уявлення про те, що відбувається на клітинному рівні під час герпетичної інфекції, і знаходять спосіб уповільнити прогресування інфекції.
Емануель Вайлер, доктор філософії та Ведран Франке, доктор філософії, з Берлінського інституту біології медичних систем, Німеччина, є співавторами нової статті, яка виходить у журналі Природні комунікації.
Значення фактора транскрипції NRF2
Вчені розробили алгоритм, який дозволив їм передбачити, як буде прогресувати інфекція в окремих клітинах.
Дослідники використовували послідовність одноклітинних РНК для аналізу 12 000 клітин шкіри людини, інфікованих вірусом простого герпесу 1 (HSV1). Одноклітинне секвенування РНК - це революційна техніка, яка дозволяє генетичну експресію розщеплювати на значно більш гранульований рівень, ніж масивна секвенування РНК.
Дослідники пояснюють різницю між секвенуванням одноклітинної РНК та звичайною масовою секвенуванням РНК, використовуючи аналогію смузі.
"Якщо я покладу в блендер десять видів фруктів, я можу приблизно сказати, що смузі містить, скажімо, ожину, коли я його скуштую", - пояснює Вайлер. “З одноклітинним секвенуванням РНК ми не робимо смузі - ми готуємо фруктовий салат. Я можу одразу ідентифікувати ожину і сказати, скільки саме її в салаті ».
Ця техніка в поєднанні з алгоритмом показала дослідникам, що фактор транскрипції, який називається NRF2, відіграє ключову роль, і його активація гальмує прогресування інфекції.
Фактори транскрипції - це білки, які «розшифровують» інформацію з нашого геному та активують або деактивують конкретні гени, зв'язуючись з певними ділянками ДНК.
Франке пояснює, як нова техніка виявила значення фактора транскрипції NRF2.
"Я візуалізував зміни в регуляції кожного гена, який ми досліджували в одній клітині", - говорить він. "Це показало нам, що рівень активації фактора транскрипції NRF2 може бути маркером тимчасової стійкості до інфекції HSV1".
Дослідники також виявили, що два агоністи NRF2, або активатори, які називаються бардоксолоновим метилом та сульфорафаном, погіршують продукцію вірусу, тобто вони змушують вірус активувати менше власних генів. Це підтвердило дослідникам ключову роль NRF2.
Бардоксолон метил - препарат, призначений для лікування хронічної інфекції нирок. В даний час він перебуває на третьому етапі клінічних випробувань.
Нарешті, дослідження також показало, що стадія клітинного циклу також впливає на те, наскільки клітина вразлива до інфекції HSV1.
Дослідники пояснюють, що вірус герпесу є хорошим "загальним планом" для дослідження стану клітин при вірусних інфекціях, і вони планують використовувати послідовність одноклітинних РНК для вивчення майбутніх вірусів.
